Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMC1Q7Z7K0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms