Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYDE1Q6ZW31 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms