Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms