Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBR3Q6ZT12 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBR3Q6ZT12 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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