Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM29Q5VYK3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms