Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM208BQ5VWN6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms