Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms