Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBAP2Q5T6F2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBAP2Q5T6F2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms