Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAMD9Q5K651 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms