Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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