Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms