Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL40Q2TBA0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms