Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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