Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HADHQ16836 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HADHQ16836 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HADHQ16836 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms