Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FXNQ16595 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FXNQ16595 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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