Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SSX1Q16384 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSX1Q16384 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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