Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA2Q15560 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms