Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP1Q15431 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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