Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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