Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAPTM4AQ15012 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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