Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDCD11Q14690 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDCD11Q14690 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms