Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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