Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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FAT1Q14517 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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FAT1Q14517 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT1Q14517 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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