Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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