Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6HQ13956 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6HQ13956 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDE6HQ13956 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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