Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKP1Q13835 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms