Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCGB2A2Q13296 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms