Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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