Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLFQ13129 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLFQ13129 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLFQ13129 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RLFQ13129 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RLFQ13129 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RLFQ13129 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RLFQ13129 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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