Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CHAF1BQ13112 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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