Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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