Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BNIP1Q12981 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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