Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TP53BP1Q12888 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms