Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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RAB40BQ12829 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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RAB40BQ12829 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB40BQ12829 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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