Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GTF3C1Q12789 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF3C1Q12789 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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