Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SREBF2Q12772 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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