Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CGNL1Q0VF96 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms