Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCBP1Q09161 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCBP1Q09161 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms