Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms