Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms