Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PUDPQ08623 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms