Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms