Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms