Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms