Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC10Q01780 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms