Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRB1P82279 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRB1P82279 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRB1P82279 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRB1P82279 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms