Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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