Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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TMEM258P61165 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TMEM258P61165 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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