Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP98P52948 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP98P52948 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP98P52948 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms