Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms